1.กลุ่มบริหารทั่วไป โครงสร้างภายในกลุ่มบริหารทั่วไป ประกอบด้วย 7 กลุ่มงาน ดังนี้
1.งานกฎหมาย 2.งานธุรการ 3.งานการเจ้าหน้าที่ 4.งานการเงินและบัญชี 5.งานพัสดุ
6.งานยานพาหนะ   7.งานอาคารสถานที่
1.1 งานกฎหมาย มีหน้าที่
  1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย และพัฒนาองค์ความรู้เกี่ยวกับการดำเนินงานด้านกฎหมายและข้อมูลการเฝ้าระวัง เพื่อพัฒนาและปรับปรุงให้เป็นไปตามกฎหมายและนโยบายของกรมควบคุมโรค
  2) ดำเนินการเกี่ยวกับพระราชบัญญัติ รวมทั้งระเบียบ ประกาศ ตำสั่ง และกฎหมายอื่น ๆ ที่อยู่ใรความรับผิดชอบของหน่วยงาน
  3) เผยแพร่ ถ่ายทอด ให้คำปรึกษา องค์ความรู้และเทคโนโลยีด้านการบังคับใช้กฎหมายให้แก่หน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น ประชาชน และหน่วยงานอื่นในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
  4) ส่งเสริมและสนับสนุนการดำเนินงานการเฝ้าระวัง และบังคับใช้กฎหมายของกรมควบคุมโรค แก่หน่วยงานที่เกี่ยวข้อง
  5) ดำเนินการเกี่ยวกับงานนิติกรรมและสัญญา งานความรับผิดทางแพ่งและทางอาญา งานคดีปกครอง งานวินัยและความรับผิดทางละเมิด และงานคดีอื่นที่อยู่ในหน้าที่และอำนาจของหน่วยงาน
  6) ดำเนินการบังคับใช้กฎหมาย มาตรการทางปกครอง การะงับข้อพิพาทและงานอื่นที่เกี่ยวข้องกับกฎหมายที่อยู่ในหน้าที่และอำนาจของหน่วยงาน
  7) การวิเคราะห์ และตรวจสอบสรุปข้อเท็จจริงเกี่ยวกับเรื่องร้องเรียนของหน่วยงาน
  8) ปฏิบัติงานอื่น ๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
1.2 งานธุรการ มีหน้าที่
  1) ดำเนินการด้านงานสารบรรณ รับ - ส่ง ร่าง จัดพิมพ์หนังสือและเอกสารราชการบริการค้นหา จัดเก็บรวบรวมข้อมูล เพื่อให้การปฏิบัติงานเป็นไปตามระเบียบวิธีปฏิบัติและมาตรฐานที่กำหนด สะดวกต่อการค้นหาและเป็นฐานข้อมูลที่ตรวจสอบได้
  2) ให้คำปรึกษาและข้อเสนอแนะที่เป็นประโยชน์ในการปฏิบัติงานด้านธุรการ สารบรรณอิเล็กทรอนิกส์และอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้อง เพื่อให้มีความเข้าใจและสามารถปฏิบัติงานได้อย่างถูกต้อง
 3) ดำเนินการประชาสัมพันธ์ เผยแพร่ข่าวสาร กิจกรรม ความรู้ จากกรมควบคุมโรคและหน่วยงานต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้อง เพื่อให้ข้าราชการในหน่วยงานรับรู้และเข้าร่วมกิจกรรมตามที่กำหนด
 4) ปฏิบัติงานอื่น ๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
1.3 งานการเจ้าหน้าที่ มีหน้าที่
  1) ศึกษา วิเคราะห์ โครงสร้างและอัตรากำลังและการสรรหา การคัดเลือก การบรรจุแต่งตั้งการประเมินผล การพัฒนาบุคลากร รวมทั้งการดูแลด้านสิทธิประโยชน์ ทะเบียนประวัติ จัดทำบัตรประจำตัวเจ้าหน้าที่รัฐ สวัสดิการ และวินัยของข้าราชการ พนักงานราชการ พนักงานกระทรวงสาธารณสุขและลูกจ้างประจำ เพื่อให้มีการบริหารงานบุคคลและอัตรากำลังที่เหมาะสมกับบทบาทภารกิจของหน่วยงาน
  2) ดำเนินการตรวจสอบและกลั่นกรองเบื้องต้นในการขอแต่งตั้ง ย้าย โอน ลาออก บำเหน็จบำนาญของบุคลากร เพื่อให้การบริหารทรัพยากรบุคคลเป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพ
  3) ตรวจสอบและดำเนินการ สอบคัดเลือก/คัดเลือก เพื่อปรับระดับชั้นงานของ พนักงานราชการ พนักงานกระทรวงสาธารณสุข ลูกจ้างประจำ เพื่อให้การบริการงานเป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพ
  4) ดำเนินการเลือกสรรพนักงานราชการ ลูกจ้างชั่วคราวโครงการเงินนอกงบประมาณการจัดทำสัญญาจ้าง คำสั่งจ้าง การเลิกจ้าง และการลาออก เพื่อให้การบริหารพนักงานราชการและลูกจ้างชั่วคราวโครงการเงินนอกงบประมาณ เป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพ
  5) ดำเนินการประเมินผลการปฏิบัติงาน การพิจารณาความดีความชอบในการเลื่อนเงินเดือนของข้าราชการ ค่าจ้างลูกจ้าประจำ ค่าตอบแทนของพนักงานราชการ และค่าจ้างพนักงานกระทรวงสาธาธารณสุขเพื่อให้เกิดความเป็นธรรม โปร่งใส และเป็นไปตามหลักเกณฑ์ที่กำหนด
  6) ให้คำปรึกษาและข้อเสนอแนะที่เป็นประโยชน์ในการปฏิบัติงานแก่บุคลากรในหน่วยงานเพื่อให้มีความเข้าใจและสามารถปฏิบัติงานได้อย่างถูกต้อง
  7) พัฒนาระบบบริหารผลการปฏิบัติงาน (PMS) ของบุคลากร
  8) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
1.4 งานการเงินและบัญชี มีหน้าที่
  1) ศึกษา วิเคราะห์ กระบวนการปฏิบัติงานด้านการเงินและบัญชี เพื่อจัดวางระบบการปฏิบัติงาน ให้เป็นมาตรฐาน
  2) ดำเนินการเกี่ยวกับการปฏิบัติงานด้านการเงินและบัญชี เพื่อให้การรับจ่ายเงินมีประสิทธิภาพถูกต้องตามระเบียบ
  3) ควบคุม ตรวจสอบ รายงานการเงินเกี่ยวกับการบริหารงานบัญชีการเงินภาครัฐ ระบบการเงินการคลังภาครัฐแบบอิเล็กทรอนิกส์ (GFMIS) เพื่อให้รายงานการเงินและบัญชี มีความถูกต้องครบถ้วนตามเกณฑ์ตัวชี้วัดที่กรมบัญชีกลางกำหนด
  4) ให้คำปรึกษาและข้อเสนอแนะที่เป็นประโยชน์ในการปฏิบัติงาน ถ่ายทอดความรู้และแก้ปัญหา ต่าง ๆ ที่เกิดขึ้นให้แก่เจ้าหน้าที่ในสายงานหรือกลุ่มต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องเพื่อให้มีความเข้าใจและปฏิบัติงานได้อย่างถูกต้อง
  5) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
 1.5 งานพัสดุ มีหน้าที่
   1) ศึกษา วิเคราะห์ ระบบบริหารงานพัสด เพื่อให้การปฏิบัติงานเป็นไปตามพระราชบัญญัติระเบียบ กฎหมาย และคำสั่งที่เกี่ยวข้อง
   2) ดำเนินการหาพัสดุโดยวิธีต่าง ๆ เพื่อให้ได้พัสดุเป็นไปตามแผนการจัดซื้อจัดจ้างและถูกต้องตามพระราชบัญญัติการจัดชื่อจัดจ้าง ระเบียบ กฎหมายและคำสั่งที่เที่เกี่ยวข้อง
  3) ดำเนินการจัดทำบัญชีพัสดุ การจัดทำทะเบียนการเบิกจ่าย การควบคุมพัสดุ การตรวจสอบพัสดุประจำปี เพื่อใช้เป็นข้อมูลในการบริหาร 
งานพัสดอย่างมีประสิทธิภาพ
  4) ดำเนินการจัดการด้านคลังพัสดุ เช่น การลงทะเบียน การรับ - จ่าย การเก็บรักษาเพื่อให้
การบริหารงานพัสดุมีประสิทธิภาพ
  5) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
1.6 งานยานพาหนะ มีหน้าที่
  1) ดูแล จัดการ การใช้รถยนต์ราชการภายในหน่วยงานให้มีความเรียบร้อย พร้อมทั้งบำรุงรักษาการใช้รถยนต์เพื่อให้รถยนต์อยู่ในสภาพพร้อมใช้งานตลลอดเวลา
  2) ให้คำปรึกษาและข้อเสนอแนะที่เป็นประโยชน์ในการปฏิบัติงาน ถ่ายทอดความรู้ แก้ไขปัญหาต่างๆ ที่เกี่ยวข้องเพื่อให้มีความเข้าใจและสามารถปฏิบัติงานได้อย่างถูกต้องสมบูรณ์และมีประสิทธิภาพ
1.7 งานอาคารสถานที่ มีหน้าที่
  1) ตรวจสอบ ดูแล ปรับปรุง ซ่อมแชม บำรุงรักษาอุปกรณ์ อาคารสถานที่และสิ่งแวดล้อมภายในหน่วยงานและบริเวณโดยรอบ เพื่อให้สถานที่และสิ่งแวดล้อมในการทำงานมีความปลอดภัยถูกสุขลักษณะและมีบรรยากาศที่ดีในการทำงาน
  2) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย

2.กลุ่มพัฒนาองค์กร มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) พัฒนาระบบคุณภาพบริหารจัดการองค์กรตามแนวทาง มาตรฐาน ตามที่กรมควบคุมโรคกำหนด (PMQA)
2) การบริหารจัดการทรัพยากรบุคคล รวมถึงการวางแผนพัฒนาบุคลากรให้มีศักยภาพและสมรรถนะ การดำเนินงานตามภารกิจของหน่วยงานอย่างมีประสิทธิภาพ คุณภาพ และประสิทธิผล
3) พัฒนาระบบการจัดทำ กำกับ ติดตาม ปรับปรุงให้ผลการปฏิบัติงานบรรลุผลตามเป้าหมายตัวชี้วัดคำรับรอง การปฏิบัติราชการของบุคลากร/กลุ่มงาน/หน่วย/หน่วยงาน
4) จัดทำแผนพัฒนารายบุคคล ของบุคลากรในหน่วยงาน (IDP)
5) พัฒนาและเสริมสร้างระบบองค์กร ให้เป็นองค์กรคุณธรรม และจริยธรรม โปร่งใสตรวจสอบได้บุคลากรเป็นผู้มีคุณธรรม จริยธรรม
6) พัฒนาศักยภาพและความร่วมมือ บูรณาการงานเฝ้าระวัง ป้องกัน ควบคุมโรคและภัยสุขภาพ ร่วมกับภาคีเครือข่ายต่างๆที่เกี่ยวข้อง รวมถึงเครือข่ายองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และเครือข่ายป้องกันควบคุมโรคในเขตเมืองเพื่อแก้ไขปัญหาโรคและภัยสุขภาพในพื้นที่เขตสุขภาพที่ ๓
7) พัฒนาข้อเสนอแนะเชิงนโยบายการดำเนินงานเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพที่เป็นปัญหาสำคัญแก่ภาคีเครือข่าย รวมถึงภาคีเครือข่ายองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และเครือข่ายเขตเมือง
8) พัฒนาระบบฐานข้อมูลการเฝ้าระวังโรคและภัยสุขภาพร่วมกับภาคีเครือข่ายต่างๆ รวมถึงภาคีเครือข่ายองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และเครือข่ายเขตเมือง
9) ประสาน ส่งเสริม สนับสนุนการพัฒนารูปแบบ/นโยบาย/ มาตรการ/แนวทางด้านการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพ ให้แก่ภาคีเครือข่ายต่างๆ รวมถึงภาคีเครือข่ายองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นและเครือข่ายเขตเมือง
10) ติดตาม ประเมินผล และให้ข้อเสนอแนะเชิงนโยบายการดำเนินงานเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพที่เป็น ปัญหาสำคัญแก่ภาคีเครือข่ายต่างๆ รวมถึงภาคีเครือข่ายองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นและเครือข่ายเขตเมือง
11) ประสานสนับสนุนหน่วยงานหลักในการขับเคลื่อนและเยี่ยมเสริมพลัง การจัดการปัญหาโรคและภัยสุขภาพในระดับพื้นที่ และเครือข่ายอื่น ทั้งภายในและภายนอกกระทรวงสาธารณสุข
12) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้อง และได้รับมอบหมาย

3. กลุ่มยุทธศาสตร์และแผนงาน มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย และพัฒนากลไกการประเมินผลสัมฤทธิ์ของการดำเนินงานและจัดทำข้อเสนอ เชิงนโยบาย พัฒนาและขับเคลื่อนนโยบาย ที่สำคัญต่อการดำเนินการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุบคุมโรคและภัยสุขภาพที่เป็นปัญหาในพื้นที่
2) สื่อสาร กำหนด ประสานการจัดทำแผนปฏิบัติราชการของหน่วยงาน และกำกับติดตามและประเมินผลตัวชี้วัดยุทธศาสตร์ กรมควบคุมโรค ยุทธศาสตร์หน่วยงาน ให้เกิดผลสัมฤทธิ์บรรลุเป้าหมายผลผลิต ผลลัพธ์ และลดผลกระทบ
3) กำหนดแนวทางการใช้จ่ายงบประมาณ กำกับติดตาม ปรับแผนการดำเนินงานเงินงบประมาณและเงินนอกงบประมาณ
 4) พัฒนาศักยภาพเครือข่ายระดับจังหวัด อำเภอ ตำบล องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นและเครือข่ายต่างๆ ในด้านการวางแผนและประเมินผล การส่งเสริมสุขภาพและป้องกันโรค เพื่อสร้างเสริมความร่วมมือ รวมทั้งการประสานเขตสุขภาพ การตรวจราชการ และนิเทศงาม
 5) ประสาน สนับสนุนหน่วยงานหลักในการขับเคลื่อนและเยี่ยมเสริมพลังการจัดการปัญหาโรคและภัยสุขภาพในระดับพื้นที่ เครือข่ายอื่น ทั้งภายในและภายนอกกระทรวงสาธารณสุข
 6) ประสาน สนับสนุนหน่วยงานหลักในการขับเคลื่อนโครงการพิเศษและงานตามนโยบายเร่งด่วนของกรมควบคุมโรค กระทรวงสาธารณสุข และเครือข่ายอื่น ในเชิงบูรณาการ
  7) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย

4. กลุ่มพัฒนานวัตกรรมและวิจัย มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษาค้นคว้า วิเคราะห์ วิจัย พัฒนาองค์ความรู้ คิดค้นรูปแบบ นวัตกรรม หรือเทคโนโลยีเพื่อเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพที่เหมาะสมกับสภาพพื้นที่ และประชาชนกลุ่มเป้าหมาย
2) วิเคราะห์ สังเคราะห์ความต้องการ การผลิตผลงานวิชาการ วิจัย จัดการองค์ความรู้ (KM)นวัตกรรมมาตรการ มาตรฐานการปฏิบัติงาน (50P) กฎหมายและเทคโนโลยีด้านการเฝ้าระวังกันควนควบคุมโรคและภัยสุขภาพ ตามสภาพปัญหาในพื้นที่และประชาชนกลุ่มเป้าหมาย
3) พัฒนากลไก ระบบเพื่อส่งเสริมสนับสนุนการผลิตผลงานวิชาการ วิจัย พัฒนาองค์ความรู้และคิดค้นระบบ รูปแบบ นวัตกรรมหรือเทคโนโลยี การเฝ้าระวังโรคและภัยสุขภาพให้ได้มาตรฐาน
4) ถ่ายทอดองค์ความรู้ ผลิตภัณฑ์ นวัตกรรมในองค์กร การจัดการความรู้แก่ภาคีเครือข่ายที่รับผิดชอบ เพื่อการนำไปใช้ประโยชน์ด้านการป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพ
5) พัฒนาโครงสร้างพื้นฐาน ฐานข้อมูลคลังความรู้ ผู้เชี่ยวชาญ และผลิตภัณฑ์ เพื่อสนับสนุนการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพให้กับบุคลากร และภาคีเครือข่าย
6) ประสานและดำเนินการกับสำนักงานความร่วมมือระหว่างประเทศ กรมควบคุมโรค
7) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย

5.กลุ่มสื่อสารความเสี่ยงโรคและภัยสุขภาพ มีบทบาทดังต่อไปนี้
1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย พัฒนานวัตกรรม และความรอบรู้ด้านสุขภาพการสื่อสารความเสี่ยงโรคและภัยคุกคามสุขภาพในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
2) สร้างเสริมสนับสนุนให้มีความรู้ และความรอบรู้ทางสุขภาพ (Health Literacy)การป้องกันควบคุมโรคและภัยคุกคามสุขภาพให้กับองค์กรและภาคีเครือข่าย เชื่อมโยงโดยองค์รวมในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
3) พัฒนาระบบการเฝ้าระวังข้อมูลข่าวสาร กลไก การติดต่อสื่อสารและเครือข่ายสายสาธารณะเพื่อเตรียมพร้อมรับผลกระทบจากโรคและภัยสุขภาพ และตอบโต้ข้อมูลข่าวสารที่ไม่ถูกต้อง (Infodemic) ด้านโรคและภัยคุกคามสุขภาพทั้งในการะปกติและภาวะฉุกเฉินในในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
4) พัฒนาระบบการสื่อสารความเสี่ยงโรคและภัยคุกคามสุขภาพ ให้ได้มาตรฐานสากล (กฎอนามัยระหว่างประเทศ : JEE-IHR)
5) พัฒนาและถ่ายทอดองค์ความรู้ และเทคโนโลยีการสร้างความรอบรู้ด้านสุขภาพการสื่อสารด้านการป้องกันควบคุมโรคและภัยคุกคามสุขภาพ ให้หน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น ประชาชน และสื่อมวลชน ให้เหมาะสมกับกลุ่มเป้าหมายและประชาชนทั่วไปในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
6) ประเมินผลการสื่อสารความเสี่ยงและความรอบรู้สุขภาพ ด้านโรคและภัยคุกคามสุภาพในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
7) การสร้างภาพลักษณ์องค์กร เพื่อให้หน่วยงานเป็นที่รู้จัก กับหน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น ประชาชน และสื่อมวลชนในพื้นที่ ผ่านรูปแบบและช่องทางการสื่อสารสาธารณะที่เหมาะสม
8) พัฒนาการบูรณาการข้อมูลสารสนเทศระหว่างระบบทั้งภายในและภายนอก เพื่อรองรับการเป็นศูนย์กลางภาคีเครือข่ายการเฝ้าระวังโรคและภัยสุขภาพ และให้บริการได้อย่างมีคุณภาพ
9) พัฒนาโครงสร้างพื้นฐาน ระบบฐานชัดและเทคโนโลยีสารสนทศ เพื่อสนับสนับสนุนการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพ ทั้งภายในและภายนอกหน่วยงาน
10) เพิ่มประสิทธิภาพทรัพยากรเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร ทั้งด้านฮาร์ดแวร์ ซอฟต์แวร์เครือข่าย และอัตรากำลัง อย่างมีประสิทธิภาพ สามารถรองรับการเป็นศูนย์กลางภาคีเครือข่ายการเฝ้าระวังโรคและภัยสุขภาพ ได้อย่างมีเสถียรภาพ มั่นคงและยั่งยืน
11) พัฒนาบุคลากรทางด้านเทคโนโลยีสารสนเทศและที่เกี่ยวข้องให้มีศักยภาพมีความสามารถในการบริหารจัดการเทคโนโลยีสารสนเทศ และการสื่อสารได้อย่างมีประสิทธิภาพและมีธรรมาภิบาล
12) จัดทำยุทธศาสตร์ด้านดิจิทัลเพื่อการเฝ้าระวัง ป้องกัน ควบคุมโรค และภัยสุขภาพ
13) สนับสนุนระบบปฏิบัติการด้านเทคโนโลยีสารสนเทศ และทักษะด้านดิจิทัล
14) พัฒนาระบบ และบริหารจัดการคลังข้อมูล (Data warehouse) และโครงสร้างฐานข้อมูลดิจิทัล (Digital platform)
15) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย

6. กลุ่มห้องปฏิบัติการทางการแพทย์ด้านควบคุมโรค มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย และพัฒนาองค์ความรู้ วิธีการ นวัตกรรมที่เป็นประโยชน์ต่อการวินิจฉัย เพื่อการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพ
2) ถ่ายทอดเทคโนโลยีองค์ความรู้ประสบการณ์ เป็นที่ศึกษาดูงานและฝึกอบรมด้านห้องปฏิบัติการ (Training Center) เฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพ แก่บุคลากรสาธาธารณสุขในระดับเขตและประเทศ
3) เป็นหน่วยบริการทางห้องปฏิบัติการเทคนิคการแพทย์ ที่ให้บริการตรวจวิเคราะห์ทางห้องปฏิบัติการ (Service Laboratory) ที่มีคุณภาพมาตรฐานสากล เพื่อสนับสนุนเครือข่ายสาธารณสุขในพื้นที่รับผิดชอบ ในการนำผลตรวจวิเคราะห์มาใช้ในการวินิจฉัย ค้นหาสาเหตุ วิเคราะห์ความรุนแรง ติดตามการรักษาโรค เฝ้าระวังโรคและอุบัติการณ์การดื้อยา เพื่อให้การรักษา ป้องกันและควบคุมโรคเป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพ
4) เป็นห้องปฏิบัติการอ้างอิงทางสาธารณสุขด้านการเฝ้าระวัง ป้องกัน ควบคุมโรคและภัยสุขภาพ (Reference and Public Health Laboratory)
5) สนับสนุน นิเทศติดตาม ประเมินมาตรฐานการตรวจวิเคราะห์ทางห้องปฏิบัติการของเครือข่ายและให้คำปรึกษา แนะนำในเชิงวิชาชีพแก่บุคลากรสาธารณสุขและประชาชนทั่วไป เพื่อให้การตรวจวินิจฉัยเป็นไปตามมาตรฐาน ในการป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพ ที่มีประสิทธิภาพ
6) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้อง ตามที่ได้รับมอบหมาย

7. กลุ่มระบาดวิทยาและตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุข  มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย และพัฒนาศูนย์ปฏิบัติการตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุขทั้งภายในและภายนอกหน่วยงาน ให้สามารถตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุขที่เกิดขึ้น ในพื้นที่ได้อย่างเหมาะสมตามมาตรฐาน ครอบคลุมด้านระบบ ด้านบุคลากร ด้านโครงสร้างของหน่วยงาน หน่วยงานภาคีเครือข่ายและภาคประชาชน
2) พัฒนาระบบเฝ้าระวังเหตุการณ์ผิดปกติ การเฝ้าระวังเหตุการณ์ (Event Based Surveillance) การระบาดโรคและภัยคุกคามสุขภาพ การรายงานโรคและภัยสุขภาพที่ครอบคลุม ๕ มิติ และการพยากรณ์ที่มีประสิทธิภาพ สามารถรองรับโรคภัยที่เป็นปัญหาสำคัญของพื้นที่ และโรคอุบัติใหม่ได้
3) พัฒนาสมรรถนะทีมปฏิบัติการและทีมสนับสนุนด้านระบาดวิทยาภาคสนาม (ทีม SAT,ทีม JIT, ทีม CDCU, ทีมควบคุมปัจจัยเสี่ยง ฯลฯ) ให้สามารถประเมินสถานการณ์ ควบคุมการระบาดเบื้องต้นที่จำเป็น รวมทั้งปฏิบัติงานร่วมกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในพื้นที่
4) พัฒนามาตรฐานแนวทางการเฝ้าระวังโรค การสอบสวนทางระบาดวิทยา และเครื่องมือที่ใช้
ในการเฝ้าระวังและสอบสวนโรค ที่เหมาะกับสภาพปัญหาของพื้นที่เขตรับผิดชอบ
5) พัฒนา ยกระดับ และจำกัดควบคุม ดูมาตรฐาน ระบบปฏิบัติการควบคุมโรคและตอบโต้ภาวะฉุกเฉิน ให้สามารถรับมือภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุขที่เกิดจากโรคและภัยสุขภาพในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
6) ถ่ายทอดองค์ความรู้เทคโนโลยี นวัตกรรม ด้านระบาดวิทยาและตอบโต้ภาวะฉุกเฉิน
ให้กับหน่วยงานและภาคีเครือข่ายรวมถึง ภาคประชาชน
7) ประเมินและรักษามาตรฐานด้านระบาดวิทยา การจัดการภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุขมาตรฐานทีมปฏิบัติการสอบสวนโรคและทีมตระหนักรู้สถานการณ์ (JIT & SAT) และมาตรฐานทีมปฏิบัติการด้านโรคภัยสุขภาพและปัจจัยเสี่ยงต่าง ๆ ในพื้นที่รับผิดชอบ
8) เป็นศูนย์ข้อมูลการเฝ้าระวังโรคและภัยสุขภาพที่สำคัญ และการประเมินความเสี่ยงหรือประเมินสถานการณ์เพื่อเตือนภัย เสนอมาตรการหรือแนวทางควบคุมทางระบาดวิทยา ทั้งในระยะปกติและระยะฉุกเฉิน พร้อมทั้งเชื่อมโยงกับฐานข้อมูลของภาคีเครือข่ายให้มีคุณภาพ เป็นแหล่งอ้างอิงของภาคีเครือข่าย (DDS)
9) ดำเนินการเฝ้าระวังป้องกันและควบคุมโรคเสนอแนะนโยบาย จัดทำแผนปฏิบัติการประสานงานเฝ้าระวังตามที่พระราชบัญญัติโรคติดต่อกำหนด
10) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย

8. กลุ่มโรคติดต่อ มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้  
1) ศึกษา ค้นคว้า วิเคราะห์ วิจัย นวัตกรรม เทคโนโลยี หลักเกณฑ์ รูปแบบ และพัฒนาหลักสูตรมาตรฐาน เพื่อการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคตอบโตภาวะฉุกเฉิน โรคติดต่อ โรคติดต่อจากสัตว์สู่คน โรคติดต่อทางอาหารและน้ำ โรคติดต่ออุบัติใหม่อุบัติซ้ำ โรคไข้หวัดใหญ่และโรคทางเดินหายใจ โรคหนอนพยาธิ โรคมือ เท้า ปาก งานตามโครงการพระราชดำริ สนับสนุนงานเวชศาสตร์การเดินทางและท่องเที่ยว
และโรคติดต่ออื่นๆ ที่เป็นปัญหาในพื้นที่ รวมทั้งความร่วมมือบังคับใช้กฎหมายที่เกี่ยวข้อง
2) เผยแพร่ ถ่ายทอดองค์ความรู้และเทคโนโลยี ประสานสนับสนุนการปฏิบัติงานด้านการ เฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคติดต่อจากสัตว์สู่คน โรคติดต่อทางอาหารและน้ำ โรคติดต่ออุบัติใหม่อุบัติซ้ำโรคไข้หวัดใหญ่และโรคทางเดินหายใจ โรคหนอนพยาธิ โรคมือ เท้า ปาก งานตามโครงการพระราชดำริงานเวชศาสตร์การเดินทางและท่องเที่ยว และโรคติดต่ออื่นๆ ให้กับหน่วยงานภาคีเครือข่ายหลักในพื้นที่รับผิดชอบ  
3) พัฒนาภาคีเครือข่ายหลักในพื้นที่ให้มีสมรรถนะด้านการเฝ้าระวัง ป้องกัน ควบคุมโรคติดต่อจากสัตว์สู่คน โรคติดต่อทางอาหารและน้ำ
โรคติดต่ออุบัติใหม่อุบัติซ้ำ โรคไข้หวัดใหญ่ และโรคทางเดินหายใจ โรคหนอนพยาธิ โรคมือ เท้า ปาก งานตามโครงการพระราชดำริงานเวชศาสตร์การเดินทางและท่องเที่ยวและโรคติดต่ออื่นๆ ได้ตามมาตรฐาน
4) นิเทศ ติดตาม และประเมินผลการดำเนินงานตามแผนงานโรคติดต่อ โรคติดต่อจากสัตว์สู่คน โรคติดต่อทางอาหารและน้ำ โรคติดต่ออุบัติใหม่อุบัติซ้ำ โรคไข้หวัดใหญ่และโรคทางเดินหายใจ โรคหนอนพยาธิ โรคติดต่อที่ป้องกันด้วยวัคซีน โรคติดเชื้อเฉียบพลันในเด็ก
งานเวชศาสตร์การเดินทางและท่องเที่ยว และการควบคุมโรคติดเชื้อในโรงพยาบาล
5) ประสานและสนับสนุนการปฏิบัติงานร่วมกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในด้านการบังคับใช้กฎหมาย และการดำเนินงานตามที่พระราชบัญญัติโรคติดต่อกำหนดในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
6)พัฒนาหลักสูตรการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคติดต่อ เพื่อให้ภาคีเครือข่ายในพื้นที่มีศักยภาพในการป้องกันควบคุมโรคติดต่อที่ได้มาตรฐาน
7) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้องและได้รับมอบหมาย  

9.กลุ่มโรคติดต่อเรื้อรัง  มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย พัฒนาวิชาการ นวัตกรรม เทคโนโลยี หลักเกณฑ์ รูปแบบและพัฒนาหลักสูตร มาตรฐาน เพื่อการเฝ้าระวัง ป้องกันโรคติดต่อเรื้อรังได้แก่ โรคเอดส์ โรควัณโรค ไวรัสตับอักเสบชนิดบีและซี โรคมะเร็งที่มีสาเหตุจากการติดเชื้อ งานในโครงการราชทัณฑ์ปันสุข และสนับสนุนงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาล เป็นต้น รวมทั้งความร่วมมือบังคับใช้กฎหมายที่เกี่ยวข้อง
2) เผยแพร่ ถ่ายทอดองค์ความรู้และเทคโนโลยี ประสานสนับสนุนการปฏิบัติงานด้านการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคติดต่อเรื้อรัง (โรคเอดส์ วัณโรค ไวรัสตับอักเสบชนิดบีและซี โรคมะเร็งที่มีสาเหตุจากการติดเชื้อ งานในโครงการราชทัณฑ์ปันสุข เป็นต้น) ให้กับหน่วยงานภาคีเครือข่ายหลักในพื้นที่รับผิดชอบ
3)  สนับสนุนการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรค โรคที่ป้องกันได้ด้วยวัคซีน โรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์ โรคเอดส์ โรคเรื้อน โรคที่ป้องกันได้ด้วยวัคซีน และโรคที่เกี่ยวข้องกับสุขภาพผู้เดินทาง รวมทั้งงานอาชีวเวชศาสตร์
4) พัฒนาภาคีเครือข่ายหลักในพื้นที่ให้มีสมรรถนะด้านการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุม
โรคติดต่อเรื้อรัง (โรคเอดส์ วัณโรค ไวรัสตับอักเสบชนิดบีและซี โรคมะเร็งที่มีสาเหตุจากการติดเชื้อ งานในโครงการราชทัณฑ์ปันสุข เป็นต้น) ให้ได้ตามมาตรฐาน
5) นิเทศ ติดตาม และประเมินผลการดำเนินงานตามแผนงานโรคติดต่อเรื้อรัง โรคเอดส์วัณโรค ไวรัสตับอักเสบชนิดบีและซี โรคมะเร็งที่มีสาเหตุจากการติดเชื้อ งานในโครงการราชทัณฑ์ปันสุขและงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาล เป็นต้น
6) ประสานและสนับสนุนการปฏิบัติงานร่วมกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในด้านการบังคับใช้กฎหมายที่เกี่ยวข้อง ในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
7) พัฒนาหลักสูตรการเฝ้าระวัง ป้องกันควบคุมโรคติดต่อเรื้อรัง เพื่อให้ภาคีเครือข่ายในพื้นที่มีศักยภาพในการป้องกันควบคุมโรคติดต่อเรื้อรังที่ได้มาตรฐาน
8) พัฒนาวิชาการด้านโรคติดต่อเรื้อรังให้ได้รูปแบบและมีมาตรฐานในการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรค
9) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้อง และได้รับมอบหมาย

10.กลุ่มโรคไม่ติดต่อ  มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา ค้นคว้า วิเคราะห์วิจัย นวัตกรรม เทคโนโลยี และพัฒนาหลักเกณฑ์ มาตรฐาน แนวทางคู่มือและรูปแบบการดำเนินงานเพื่อการเฝ้าระวังป้องกันโรคไม่ติดต่อ มะเร็งไร้เชื้อ การบาดเจ็บจากการจราจรและการจมน้ำ การพลัดตกหกล้มในผู้สูงอายุ การบริโภคยาสูบ และแอลกอฮอล์
2) เผยแพร่ ถ่ายทอดองค์ความรู้และเทคโนโลยีฯ การเฝ้าระวังป้องกันโรคไม่ติดต่อ มะเร็งไร้เชื้อ การบาดเจ็บจากการจราจรและการจมน้ำ การพลัดตกหกล้มในผู้สูงอายุ การบริโภคยาสูบ และแอลกอฮอล์ แก่ประชาชนกลุ่มเป้าหมาย
3) ประสานสนับสนุนการดำเนินงานการเฝ้าระวังป้องกันโรคไม่ติดต่อ มะเร็งไร้เชื้อ
การบาดเจ็บจากการจราจรและการจมน้ำ การพลัดตกหกล้มในผู้สูงอายุ การบริโภคยาสูบ และแอลกอฮอล์  
4) พัฒนาภาคีเครือข่าย ในพื้นที่ให้มีสมรรถนะด้านการเฝ้าระวังป้องกันโรคไม่ติดต่อ มะเร็ง
ไร้เชื้อการบาดเจ็บจากการจราจรและการจมน้ำ การพลัดตกหกล้มในผู้สูงอายุ การบริโภคยาสูบ และแอลกอฮอล์  
5) นิเทศติดตามและประเมินผลการดำเนินงานของภาคีเครือข่ายที่เกี่ยวข้องในพื้นที่
ในแผนงานโรคไม่ติดต่อ มะเร็งไร้เชื้อ การบาดเจ็บจากการจราจรและการจมน้ำ การพลัดตกหกล้มในผู้สูงอายุ การบริโภคยาสูบ และแอลกอฮอล์
6) ดำเนินการประชาสัมพันธ์ เผยแพร่ความรู้และบังคับใช้กฎหมายตาม พรบ.ที่เกี่ยวข้อง (การบริโภคยาสูบ/แอลกอฮอล์)
7) ประสานและสนับสนุนการปฏิบัติงานเฝ้าระวังป้องกัน การสอบสวนควบคุมโรคและตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางด้านสาธารณสุขกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในพื้นที่ด้านโรคไม่ติดต่อ การบาดเจ็บจากการจราจรและการจมน้ำ การพลัดตกหกล้มในผู้สูงอายุ การบริโภคยาสูบ และแอลกอฮอล์
8) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้อง และได้รับมอบหมาย

11.กลุ่มโรคจากการประกอบอาชีพและสิ่งแวดล้อม  มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา ค้นคว้า วิเคราะห์วิจัย นวัตกรรม เทคโนโลยี และพัฒนาหลักเกณฑ์ มาตรฐาน แนวทาง คู่มือและรูปแบบการดำเนินงานเพื่อการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคจากการประกอบอาชีพและสิ่งแวดล้อม และสนับสนุนงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาล/สถานประกอบการ/หน่วยบริการ
2) เผยแพร่ ถ่ายทอดองค์ความรู้และเทคโนโลยีฯ หลักเกณฑ์ มาตรฐาน แนวทาง คู่มือ รูปแบบการดำเนินงานด้านการเฝ้าระวัง ป้องกันและควบคุมโรคและภัยที่คุกคามสุขภาพจากการประกอบอาชีพ
และสิ่งแวดล้อม และการสื่อสารสร้างความเข้าใจและขับเคลื่อนกฎหมายที่เกี่ยวข้องให้แก่หน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นและประชาชน และสนับสนุนงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาลสถานประกอบการ/หน่วยบริการ
3) ประสาน สนับสนุนการปฏิบัติงานเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคและการตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางด้านสาธารณสุขกับหน่วยงานด้านโรคจากการประกอบอาชีพและสิ่งแวดล้อมในเขตพื้นที่ที่รับผิดชอบ และงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาลสถานประกอบการ/หน่วยบริการ
4) พัฒนาภาคีเครือข่ายหลักในพื้นที่ให้มีสมรรถนะด้านการเฝ้าระวังป้องกันควบคุมโรคและภัยสุขภาพจากการประกอบอาชีพและสิ่งแวดล้อม และงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาลสถานประกอบการ/หน่วยบริการ ได้ตามมาตรฐาน ตลอดจนดำเนินการตามกฎหมายที่เกี่ยวข้อง
5)กำกับติดตาม และประเมินผลการดำเนินงานของภาคีเครือข่ายที่เกี่ยวข้องในพื้นที่ในแผนงานด้านโรคจากการประกอบอาชีพและสิ่งแวดล้อม และงานควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาลสถานประกอบการ/หน่วยบริการ เพื่อให้ข้อเสนอเชิงนโยบายแก่ภาคีเครือข่ายที่เกี่ยวข้อง  
6) จัดให้บริการคัดกรอง ตรวจสุขภาพ ด้านสิ่งแวดล้อม ,อาชีวเวชศาสตร์ ตรวจวัดสิ่งแวดล้อมในการทำงาน เพื่อเฝ้าระวังโรคจากการประกอบอาชีพและโรคจากสิ่งแวดล้อม
7) ดำเนินการประชาสัมพันธ์ เผยแพร่ความรู้และบังคับใช้กฎหมายตาม พรบ. ที่เกี่ยวข้อง
8) ประสานและสนับสนุนการปฏิบัติงานเฝ้าระวังป้องกัน การสอบสวนควบคุมโรคและตอบโต้ภาวะฉุกเฉินทางด้านสาธารณสุขกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในพื้นที่ ด้านโรคจากการประกอบอาชีพและสิ่งแวดล้อม
9) ปฏิบัติงานอื่นที่เกี่ยวข้อง และได้รับมอบหมาย

12. กลุ่มโรคติดต่อนำโดยแมลง (ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 3.1 จังหวัดกำแพงเพชรและศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 3.2 จังหวัดนครสวรรค์) มีบทบาทหน้าที่ดังต่อไปนี้
1) ศึกษา วิเคราะห์ วิจัย พัฒนาความรู้และหลักสูตรเทคโนโลยีด้านการเฝ้าระวัง ป้องกันการสอบสวนโรคและการควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลง ให้เหมาะสมกับบริบทและสภาพของพื้นที่ที่รับผิดชอบ
2) เฝ้าระวังและประเมินความเสี่ยงทางระบาดโรคติดต่อนำโดยแมลงที่สำคัญ และเป็นปัญหาในพื้นที่
3) สนับสนุน ถ่ายทอดองค์ความรู้และเทคโนโลยีด้านการเฝ้าระวัง การป้องกัน การสอบสวนโรคและการควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงให้แก่หน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นและประชาชน ตลอดจนการเตรียมความพร้อม เพื่อรองรับและจัดการภาวะฉุกเฉินทางสาธารณสุขด้านโรคติดต่อนำโดยแมลงในเขตพื้นที่รับผิดชอบ
4) ประสานและสนับสนุนการดำเนินงานตามมาตรฐาน เกี่ยวกับหลักเกณฑ์และรูปแบบการดำเนินงานเฝ้าระวัง การป้องกัน การควบคุมและกำจัดพาหะนำโรคติดต่อนำโดยแมลงตามบริบทของพื้นที่
5) กำกับ ติดตาม ประเมินและตรวจสอบมาตรฐานจัดตั้งศูนย์เครื่องพ่นเคมีและทดสอบมาตรฐานสารเคมีที่ใช้ในงานด้านสาธารณสุข
6) ดำเนินการทดสอบประสิ<